县医疗保障中心的主要职责是:负责办理全县基本医疗保险、生育保险，医疗救助业务，负责用人单位和城乡居民的参保登记、就医待遇审核费费用报销。负责各定点医疗机构和定点零售药店的协议管理。承担县医疗保障局交办的其他工作。